1990年代後期臺北縣政府採納地方建議設立烏來泰雅文物館，並補助烏來鄉公所(現改制為烏來區公所)參仟餘萬元興建經費。

2001年7月18日動土開工。

2003年2月完成主題結構工程。

2003年8月臺北縣政府召開協調會議決議，場館由縣府文化局進行營運及管理規劃。

2003年10月29日時任縣長蘇貞昌裁示定名為「臺北縣烏來泰雅民族博物館」。

2003年12月完成展示研究及設計規劃。

2004年6月完成第一期裝修展示工程。

2005年1月1日臺北縣政府因機關業務調整，博物館之營運管理由「文化局」移至「建設局風景特定區管理所」。

2005年7月完成第二期裝修展示工程，並於同月起試營運。

2005年10月1日正式營運，開放參觀。

2007年7月1日營運管理由「建設局風景特定區管理所」變更為「原住民族行政局」。